BactoSCREEN: описание методики

1. Единичная колония первичного посева

2. Наносится на мишень прибора

3. На образец наслаивается 1 мкл раствора матрицы (α-циано-4-гидроксикоричная кислота)

4. Мишень помещается в прибор

5. ПО обеспечивает:

снятие спектра;
обработку полученного спектра;
сравнение спектра неизвестного микроорганизма со спектрами из базы данных;
идентификацию микроорганизма.

В основе идентификации микроорганизмов с помощью системы MALDI BactoSCREEN лежит получение спектра константных белков неизвестного микроорганизма с помощью MALDI TOF масс-спектрометра и последующее сравнение полученного спектра с базой данных.

Процедура пробоподготовки состоит в перенесении единичной колонии микроорганизмов на мишень прибора и наслоении раствора матрицы (α-циано–4-гидроксикоричная кислота) поверх анализируемого образца. Мишень прибора с нанесенными образцами помещается в масс-спектромет. С образца снимается суммарный спектр, состоящий из 240 единичных спектров. Суммарный спектр преобразуется в «основной спектр» (набор пиков разных масс), который сравнивается со спектрами базы данных. При сравнении для каждого спектра из базы данных высчитывается коэффициент совпадения со спектром неизвестного микроорганизма. Микроорганизм, чей масс-спектр имеет наибольшее значение данного коэффициента, вносится в таблицу результатов. При этом достоверными считаются результаты, для которых значение коэффициента совпадения выше определенной величины.